Miasto leży w powiecie kwidzyńskim, w otoczeniu jeziora Liwieniec, Sowica i Dzierzgoń. Geograficznie tereny te znajdują się w obszarze Pojezierza Iławskiego, które jest najdalej na wschód wysuniętą częścią Pojezierzy Południowobałtyckich. Prabuty historycznie przynależały do Powiśla (dawniej znanego także pod nazwą Pomezania).
Prabuty stanowią ważny węzeł drogowy w okolicy. W mieście krzyżują się 3 szlaki komunikacyjne regionu, mianowicie droga wojewódzka 520, droga wojewódzka 521 i droga wojewódzka 522. Łączą one miasto m.in. ze Sztumem, Mikołajkami Pomorskimi, Kwidzynem czy Iławą.
W mieście zbiegają się 3 linie kolejowe: linia nr 9 Warszawa Wschodnia – Gdańsk Główny, linia nr 218 Myślice – Szlachta, linia nr 232 Jabłonowo Pomorskie – Prabuty. Linia nr 238 na odcinku Myślice – Prabuty została rozebrana w 1945 roku, natomiast na odcinku Prabuty – Kwidzyn od 2000 r. odbywa się jedynie ruch towarowy. Obecnie ostatnią czynną linią jest, ta biegnąca ze stolicy, nad morze. Miasto posiada kilka połączeń bezpośrednich np. z Gdańskiem, Słupskiem, Malborkiem, Iławą, Krakowem, Warszawą i Olsztynem.
W Prabutach działają 3 placówki szkolne: Szkoła podstawowa nr 1 (dawne gimnazjum), Szkoła Podstawowa nr 2 im. Obrońców Westerplatte i Zespół Szkół Ponadgimnazjalnych.
Na terenie miasta znajduje się kilka sklepów spożywczych i supermarketów. Są to m.in. Dino (ul. Kolejowa 2), Biedronka (ul. Władysława Jagiełły 10a) i Żabka (Rynek 3/1). Ponadto w Prabutach znajdziemy drogerie Rossmann, kilka sklepów odzieżowych i wielobranżowych.
Do najciekawszych imprez organizowanych w mieście należą: Prabucki Bieg Przełajowy "Wokół Komina" (początek maja), Dni Prabut (koniec maja lub czerwiec) i Pomorze Sprint Cup (początek września).
W lipcu Prabuckie Koło Polskiego Związku Wędkarskiego organizuje maraton wędkarski. Zawody te najczęściej odbywają się w klasyfikacji drużynowej.